Temeljem Zakona o institucionalnom okviru za korištenje fondova Europske unije u Republici Hrvatskoj (NN 161/21, 31/25) te Uredbe o tijelima u sustavu upravljanja i kontrole za provedbu programa Fonda za unutarnju sigurnost, Fonda za azil, migracije i integraciju i Fonda za integrirano upravljanje granicama instrumenta za financijsku potporu u području upravljanja granicama i vizne politike za programsko razdoblje 2021. - 2027. (NN 96/2022, 98/2025), Uprava za europske poslove, međunarodne odnose i fondove Europske unije Ministarstva unutarnjih poslova određena je kao Upravljačko tijelo u sustavu upravljanja i kontrole.
Čelnik Upravljačkog tijela je odgovorna osoba za upravljanje i provođenje Programa Fonda za azil, migracije i integraciju, Programa Fonda za unutarnju sigurnost i Programa Fonda za integrirano upravljanje granicama, Instrumenta za financijsku potporu u području upravljanja granicama i vizne politike.
Poslove Upravljačkog tijela unutar Uprave za europske poslove, međunarodne odnose i fondove Europske unije izvršava Sektor za fondove Europske unije, odnosno Služba za fondove Europske unije.
Služba za fondove Europske unije:
- izvršava zadaće Upravljačkog tijela za korištenje fondova Europske unije za područje unutarnjih poslova kroz Programe na temelju relevantnih propisa Europske unije i Republike Hrvatske te opisa strukture upravljanja i kontrole;
- koordinira aktivnosti Republike Hrvatske na području pripreme struktura upravljanja i kontrole za fondove Europske unije za područje unutarnjih poslova;
- koordinira aktivnosti programiranja, pripreme, provedbe, praćenja i izvješćivanja za Programe Republike Hrvatske za fondove Europske unije za područje unutarnjih poslova;
- koordinira i ostvaruje suradnju s institucijama Europske unije, hrvatskim, međunarodnim i stranim institucijama i organizacijama;
- planira i organizira edukacije za korištenja fondova Europske unije za područje unutarnjih poslova;
- pruža stručnu potporu ustrojstvenim jedinicama Ministarstva za korištenje projekata iz pretpristupnih i pristupnih programa Europske unije;
- kontrolira natječajnu dokumentaciju, sudjeluje u pripremi objave natječaja, sudjeluje u predlaganju ovlaštenih predstavnika naručitelja te iznimno u ocjenjivanju ponuda;
- sudjeluje u realizaciji ugovora, prati provedbu programa i projekata te sudjeluje u izvješćivanju o provedbi programa i projekata iz pretpristupnih i pristupnih programa Europske unije